【艱深科學】蘇黎世團隊發佈已搵到COVID-19 病毒「致命弱點」

對抗全球新型冠狀病毒又行前一小步，據知科學家已經得知 COVID-19 病毒一個「致命弱點」，即病毒基因組和核糖體係框架轉移過程中的相互作用。病毒需要被感染細胞的資源來複製，然後感染更多細胞，並轉移到其他個體。即傳播基制病毒生命週期的一個重要步驟係根據病毒 RNA 基因組中的「指令」生產新的病毒蛋白。按照呢個構建計劃，細胞自身的蛋白質「合成機器」，即係核糖體（Ribosome）以生產病毒蛋白質。你唔明？你認為我會明？簡單講搵到任何能抑制病毒基因框移突變的化合物都有可能成為抗感染的藥物。總之科學家們「機會嚟喇！飛雲！」！

細個果陣，A level bio 鄒sir 教 DNA RNA 果陣大半班瞓咗，我就仲剩返少少，先睇得明。

實實在在想想自己讀書時學過什麼，應是面對往後日子重要的事。

有人因為我早前就有關全民測試帖文，向民政署作出投訴，說我發佈「假新聞」。

首先，我不是傳媒工作者，亦沒有經營媒體；說我是發佈新聞，實在貽笑大方。如果投訴人不懂怎樣分辯News, Facts及Opinion，請收聽上星期日《903國民教育》的重溫。

我在電郵中，花了一些時間向民政專員講解《個人資料私隱條例》在保障生物資料如何薄弱。翌日，我看見政府公佈了計劃詳情，當中提及測試相關的私隱問題。而我便將以下的生物學概念，用英文在電郵中向民政專員詳細闡述一次。

#武漢肺炎 的測試叫「核酸檢測」，是因為你身體的DNA、RNA及病毒的RNA都是nucleic acids，即是中文「核酸」。

特區港府在其「全民測試」網站中提到關於DNA樣本的問題，「抽取樣本及檢測病毒核糖核酸（RNA）的過程會涉及測試者的細胞及其中的核糖核酸（RNA）⋯⋯因此檢測過程不會收集到任何關於測試者的脫氧核糖核酸（DNA）資料。」

以我僅餘有限的預科生物學知識，都察覺到看見當中的問題。假如你不懂又或者忘記了生物堂教授過的細胞知識，Google 一下吧。

雙鏈的DNA 是會經過 RNA Polymerase 產生單鏈pre-mRNA（信使核糖核酸）。而經過完整的Transcription （轉錄）過程後就會產生 mature mRNA。而mRNA 會被 rRNA+protein 的 Ribosome 做Translation，而tRNA就會將 mRNA 鏈中的RNA排序，帶着相對的Amino Acid 往Ribosome去，從而製造一條peptide chain 出來。而條chain 再加長下去，就是protein了。

如果都是不明白，可以參考這條2分鐘短片 https://www.youtube.com/watch?v=1THyMOk3WU0

於1970年，科學家 David Baltimore 及 Howard Temin 發現RNA病毒的酶（酵素）能夠在受感染的細胞「反轉錄」成互補DNA (cDNA) ，推翻當時生物學中心法則（Central Dogma)。該發現令他們獲得1975年諾貝爾醫學獎，並改變了生物醫學的研究方向。現在的HIV抑制藥物，就是基於該發現而研發出來。

亦即是說， RNA 是可以被反轉錄成cDNA，即是一段反映特定時間「已呈現」的DNA。Reverse Transcription 更亦是時時刻刻在身體中出現，是細胞複制DNA維持健康的過程。更甚的是，Reverse Transcription ( 反轉錄）已經是很商業化的實驗，Google 一下便看到會提供相關服務的公司多不勝數。

就算「全民測試」的試劑只牽涉到測試者RNA，現時亦可以透過Reverse Transcription收集到DNA資料，更不要說FAQ中說測試會涉及細胞、細胞、細胞（因為很重要所以要講三次）了。

武漢肺炎的冠狀病毒，是RNA病毒。如果用測試劑可以只留下樣本的病毒RNA，那當然無須過份擔心。但不幸的是，暫時應該未有大廠能夠做到只提取RNA病毒的試劑 。 所以一牽涉試劑，都會是抽取RNA，不管是人、是動物抑或病毒，都是一樣。

至於如果不用抽取RNA，但仍然沿用RT-PCR 的方法去驗一個人是否確診是否可行？答案是可以的。有韓國醫學科技公司研發了不用抽取RNA都可以化驗到武肺病毒在「反轉錄」的技術（http://www.seegene.com/…/complete_solution_for_the_covid_19…）。 醫學文獻更顯示測試的效率亦有80% （https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7204723/）。瑞典亦有公司提供相關服務（ https://www.reiniuslab.com/Home ）。

既然有更加尊重私隱減少疑慮的技術，為何林鄭港府都不用，偏偏受到港人質疑要用中國技術？這個，就留待你解答了。

又一篇有趣的，今天真好

然後很多人族吃低碳水吃到碳水耐受也爆了🤣

【低糖飲食吃太久，再吃高糖竟然會死掉！】

別誤會，標題講的不是智人，而是一種罕見的果蠅「塞席爾果蠅（Drosophila sechellia）」，因為除惹實驗室以外，只住在東非外海的塞席爾群島。

《短篇 狗消化澱粉的能力，在何時開始加強？》
http://neanderthaldna.pixnet.net/blog/post/211250224

住在小島上的塞席爾果蠅，食物相當特殊。許多果蠅以爛掉的果果為主食，塞席爾果蠅大概也能吃，不過有得選擇的話，它最喜歡的是諾麗果（Morinda citrifolia）。

諾麗果對許多昆蟲有毒，卻是塞席爾果蠅的第一選擇。營養方面，諾麗果的糖分很低，因此塞席爾果蠅習慣的口味是－低糖－低能飲食。

有趣的是，塞席爾果蠅遺傳上最近的親戚，叫作「擬黃果蠅（Drosophila simulans）」，全世界許多地方都有分佈，吃的食物也很多元，甜度從高到低都有。2 種近親，飲食習慣卻差很多，是如何造成的呢？

這個論文首先比較，2 種果蠅在不同甜度中，結蛹成功的程度。用的糖是蔗糖，濃度介於 0 到 20%。結果是，不管甜度高低，擬黃果蠅生長狀況都還不錯；塞席爾果蠅卻不耐高糖，10% 就開始變差，20% 會死光光。糖對塞席爾果蠅而言，竟然是致命的毒藥！

有意思的是，2 種果蠅情慾交流生下的後代，儘管配備各一半的祖源，耐糖能力卻和擬黃果蠅差不多。這表示怕糖，源自於塞席爾果蠅的遺傳因素。

《 【小島果蠅啟示錄】看似假基因，真的會表現 ?》
https://geneonline.news/…/…/drosophila-sechellia-pseudogene/

為惹尋找哪些基因影響耐糖，研究者採取回交（backcross）的策略，希望製造出，絕大部分基因組都是塞席爾果蠅，但是配備擬黃果蠅版本的耐糖基因，所以仍能耐糖的品系。靠著 20% 蔗糖篩選，經過殘酷的 10 代考驗以後，順利獲得目標。

多代情慾交流獲得的果蠅，大部分基因組都源自塞席爾果蠅，只有染色體 2R 上的一些地方來自擬黃果蠅，不過僅靠這些擬黃果蠅的遺傳區域，耐糖能力就和 100% 的擬黃果蠅一樣好。可見耐不耐糖，只取決於少數基因。

源自擬黃果蠅的基因共有 302 個，論文選惹 102 個看起來有搞頭的繼續研究，最後覺得其中 9 個基因，和耐不耐糖比較有關係。

3 個基因（mRpL43、CG4882、bonsai）在不耐糖果蠅中，基因表現量都明顯降低。它們的蛋白質產物，都是粒線體的核糖體（ribosome）的結構成分，可見耐糖能力，與粒線體作用有關。

《短篇 長鏈脂肪酸作為訊號分子，調節粒線體功能 》
http://neanderthaldna.pixnet.net/blog/post/109714039

還有 3 個基因（SERCA、PPP1R15、Pi3K59F），參與不同的訊號傳遞路徑。SERCA 與脂質恆定有關，在不耐糖果蠅中表現量降低；而塞席爾果蠅此一基因，之所以表現量低，是由於啟動子（promoter）的 DNA 序列差異所致。（驅動比較沒力）

PPP1R15 和 Pi3K59F 則是在不耐糖果蠅中，表現量增加。有意思的是，特別研究的 9 個基因中，只有 PPP1R15 的氨基酸序列，比別人有更多改變，不過不清楚是否與耐糖有關。

另外 3 個基因（Taldo、Dpit47、GlcT-1），影響比較小。

綜合看來，果蠅切換高糖或低糖飲食，會造成很多基因的表現量改變，不過耐糖與否，關鍵只在於相對少數的基因，與粒線體作用，以及訊號傳遞有關。

還有個有趣的問題是，塞席爾果蠅「為什麼」怕糖？一個可能是漂變，它們平時只吃低糖，沒機會碰到高糖食物，應付高糖的能力，也就隨機消逝惹。另一個可能是適應，長期仰賴低能飲食下，處理高糖的基因版本不利於生存，因此被天擇消滅。

論文認為，在微糖飲食下的發育狀況，不耐糖和塞席爾果蠅，都勝過耐糖與擬黃果蠅，所以耐糖能力的喪失，大概不是隨機，而是有利的適應導致。

奇怪，寫完突然好想吃奶昔～

論文：
https://elifesciences.org/articles/40841
新聞稿：
https://www.eurekalert.org/pub_re…/2019-01/uoh-ffh010319.php
圖片：
https://www.datahand.com/sugar-level-by-beverage.html