※ 引述《kokomi72 (心中的太陽)》之銘言：
: 【問題】：藻類被歸類在原生生物界的原因？
: 【問題起因】：多數藻類具有葉綠素，可以行光合作用。為何不歸類在植物界？

藻類的演化起源與植物大不相同。

以前高中生物課本上說用葉綠素 ab 來分類，那是很古老以前的方式。
現今分類主要是用 plastid 16S rRNA。

基本上藻類 (algae) 這個詞跟類群包含了非常複雜的分類地位跟概念。

藻類的演化非常的複雜，牽涉到 serial endosymbiosis 理論。
因此各種藻類其 plastid 的演化來源不同。怎麼說呢？

Plastid 是一類胞器的總稱，當中大家最熟悉的就是 chloroplast
(葉綠體) 了。除此之外還有非常多種類不同功能的 plastid。
它們的來源是遠古以前被吃進來的 cyanobacterium (藍綠菌)，是一個
原核生物。這也是大家相當熟悉的，葉綠體的來源。

但在演化過程中，這種一個真核細胞吃了另外一個原核細胞，甚至
吃了另外一個真核細胞的事情，不斷重複上演。也因此增加 plastid
演化的複雜性。

事實上像渦鞭毛藻 (dinoflagellate) 他的葉綠體是經由
二次甚至三次胞內共生而來。其複雜性可想而知。
另外許多藻類還有陸生植物所沒有的胞器 (例如造粉體, pyrenoid)，
與獨特的生理功能。藻類與植物不是單純單支的起源。

小結一下，回到你的問題，葉綠體的有無，
並不作為分類成植物與否的依據。目前分類主要是依據 plastid 的演化。
因此現在所稱植物界這些陸生植物，其 plastid 的來源，特性與功能，
在在都與藻類不同。

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