[爆卦]基因 定 序 Illumina是什麼?優點缺點精華區懶人包

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  • 基因 在 國家衛生研究院-論壇 Facebook 的最讚貼文

    2021-10-01 07:30:27
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    【打開「新冠病毒」的潘朵拉盒子】
    2019年11月17日,中國湖北省武漢市一張胸部電腦斷層掃描(CT)影像出現毛玻璃狀結節(nodule),疑似新型肺炎病例,病因成謎。隨著年關將近,人們在12月開始頻繁奔波各地,武漢市位居中國交通樞紐,陸續發現數起新型肺炎的病例。疫情似乎悄悄蔓延。
     
    同年12月30日武漢中心醫院醫師李文亮透過網路社群通知同事,華南海鮮市場出現類似嚴重急性呼吸道症候群(SARS)的病患,應小心防護。不幸的是,李文亮醫師因這種新型肺炎於今年2月7日病逝於武漢金銀潭醫院。
     
    英國醫學期刊《刺絡針》(Lancet)特別於2月18日發文悼念李文亮,引述了美國約翰霍普金斯大學彭博公衛學院主任英格勒斯比(Tom Inglesby)的一句話:「世界上最重要的預警系統是,醫護人員意識到某種新疾病正在出現,然後發出警報。」
     
    醫學界現在清楚知道這種新疾病是由人傳人的新冠病毒(SARS-CoV-2)所引起,命名為嚴重特殊傳染性肺炎。但人們太晚意識到「吹哨人」發出的警報,低估新冠病毒的傳染力,疫情迅速從中國傳到新加坡、韓國、日本等亞洲區域,蔓延到歐洲地區(特別是義大利以及西班牙),再擴散至美洲地區(美國紐約成為重災區),死亡和感染病例以指數型曲線與日俱增,人類正面臨21世紀的瘟疫[1]。
     
    ■什麼是病毒
    病毒是一種寄生在於細胞內的微小生物體,感染的對象涵蓋細菌、古菌和所有的真核生物。病毒的構造極為簡單,主要包括四層結構,由內而外依序為:位於核心的遺傳物質、蛋白質構成的衣殼、源自於宿主細胞膜的脂質外套膜、以及具有宿主專一性的特殊蛋白質。
     
    某些病毒的構造甚至更為精簡,不具有外套膜。由於缺乏複製遺傳物質與合成蛋白質所需的材料和環境元素,病毒的生存繁殖需要完全仰賴宿主細胞;而脫離細胞體的病毒,其活性可以維持數分到數小時不等。
     
    目前已知的病毒種類共有489種病毒,因病毒具有高突變率,衍生出的亞種通常具有不同程度的感染力和致病性。除此之外,病毒毒性的差異亦見於不同的宿主物種間。隨著自然環境變遷的壓力與日俱增,似乎也加速了病毒演化的時程:擴大感染的物種範圍以及產生新種病毒。
     
    以近數十年來侵襲人類的新變異株或新種病毒為例,有些已經成功地潛伏在人類的群落裡(如:愛滋病毒);而毒性強的新變異株(如:伊波拉病毒、 SARS病毒),則以低致病性的形態潛藏於原始的宿主物種當中。這些現象投映出病毒演變的縮影,也展現了病毒病絕佳的可變性和適應力。
     
    病毒的起源現今仍未有定論,若從部份病毒基因的相似性橫跨了原藻以至於脊椎動物的角度來看,病毒可能是演化上最原始的生命形態;然而,另一種說法是:細胞的基因組意外地分割出可以獨立複製的基因片段,形成病毒顆粒的前身。無論如何,可以確定的是,精巧詭變的生存策略足以讓病毒成為演化長河中最淵遠流長的物種[2]。
     
    ■病毒與人
    傳染病的流行,常常會影響人類的所有活動。歷史上的社會榮枯、文化起落、宗教興滅、政體變革、產業轉型、科技發展,都和傳染病的流行有密切的關係。戰爭的勝敗也可決定於傳染病的蔓延。在中世紀的圍城戰爭中,曾經將黑死病患者的屍體當作武器,以強力彈弓拋擲到城堡裡,讓守城敵軍得病死亡,進而不戰而勝。
     
    ■影響人類至巨的流行病毒
    當新種病毒出現時,所有人類對它都沒有抵抗力,一旦傳染開來,流行就大為爆發,使得民眾陷入一無所知的高度恐慌當中。像二十世紀的多次流行性感冒、愛滋病和狂牛症等,在擴散蔓延的初期,帶給人們極度懸疑的不確定性和不安全感。
     
    一直等到醫學界闡明了感染途徑及擴散風險、重症與致死比例、易感受宿主特徵、病原體真面目、有效防治措施之後,人們才逐漸消滅心中的不安[3]。
     
    ■會感染人類的冠狀病毒
    會感染人類的冠狀病毒包括:引起輕微症狀的人類冠狀病毒OC43、HKU1、NL63、229E,以及引起嚴重症狀的中東呼吸症候群冠狀病毒(MERS-CoV)、嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒(SARS-CoV)、新冠病毒。
     
    從基因組分析可發現,新冠病毒與SARS病毒基因相同度約有80%,複製酶的胺基酸序列相同度達到94%,表明這兩種病毒屬於同一類;而新冠病毒與中國雲南當地的中華菊頭蝠(Rhinolophus affinis)冠狀病毒RaTG13整體基因相同度更達到96%,代表演化關係更接近。
     
    但如果比較與感染細胞直接相關的棘蛋白(spike protein)基因組,新冠病毒與中華菊頭蝠(Rhinolophus affinis)冠狀病毒RaTG13的相同度高達93%,與SARS病毒的相同度卻只有75%左右,因此科學家已排除新冠病毒與SARS病毒的同源關係[1]。
     
    ■病毒是比人類更高級的存在!
    科學家們尊稱為「冠狀病毒之父」的中研院院士、病毒學家賴明詔在 30 年前開始投入冠狀病毒研究,那時冠狀病毒被認為只是「感冒病毒」,研究的人少,非常冷門,連申請研究經費時,他都要再三強調「冠狀病毒未來會很重要」,才能順利過關。
     
    直到 2003 年,亞洲地區爆發 SARS 疫情,才讓冠狀病毒成為病毒學研究的大熱門,更發現這或許是對人類最有威脅性的一種病毒。賴明詔院士直言「人類不可能比得過病毒,冠狀病毒比冠狀病毒學家還要聰明,病毒一定有很多奇妙的方法,可以把不可能的事情變成可能。」
     
    ■賴明詔院士:「永遠會有新興病毒出現」
    病毒可以分成 DNA 病毒、RNA 病毒 2 種,DNA 病毒在複製的時候,需要複製雙股的基因,還要經過轉譯的作用;所以速度比較慢、也比較不容易突變、進化,相對來說是比較好控制的病毒。
     
    但 RNA 病毒只有單股,複製速度快、又容易突變,相對來說比較難控制,像是愛滋病病毒就是 RNA 病毒,它也是世界上最難治療的疾病之一。
     
    賴明詔院士說,而冠狀病毒又是 RNA 病毒中,最特別的病毒。「它有世界最長的 RNA 基因,有 3 萬個鹼基(承載基因的單位),理論上這樣的基因不應該存在,因為 RNA 複製時常常會出錯,所以超過 1 萬個鹼基之後,很多基因就會失去功能。但冠狀病毒可以遠遠超過這個數目,必然有個改變,可以去彌補出錯的問題。」賴明詔院士說。
     
    而這次的新冠病毒又比以往的 SARS 傳播力更強,賴明詔院士說,「新型冠狀病毒跟 SARS 的病毒是很相近,但病毒受體的附著力將近高了 20 倍,可能是因為這樣所以傳播力很高,這是非常、非常奇怪的,我們以為新的病毒突變以後不會附著在受體,但附著力反而增加這麼多。」
     
    在這樣的狀況下,賴明詔院士說,不管是動物跟動物接觸、還是動物跟人接觸,都可能產生出新的病毒,「只要接觸越來越多,我相信這個新的病毒會不斷的、繼續產生,而且會持續演化。」
     
    ■蝙蝠是冠狀病毒最重要的動物關鍵
    跟冠狀病毒最緊密連結的動物,其實是「蝙蝠」。雖然很多動物身上都會帶有冠狀病毒,但目前觀察到的動物,只有蝙蝠可以跟冠狀病毒完全和平相處。
     
    台灣病毒學權威、研究病毒數十年的徐明達教授說:「因為蝙蝠本身有很多可以抑制病毒發展的因素,一個是牠會製造很多干擾素,抑制病毒的發展,但是製造太多干擾素會影響細胞的活性,讓感染更厲害;但冠狀病毒在人身上,不會引起干擾素的製造,而蝙蝠有另外一些因素,很多干擾素也不會影響細胞。」徐明達教授說。
     
    再加上蝙蝠的壽命很長,有的甚至可以存活四十年,種類又多、因此會帶有變種的病毒,同時數量也很多,病毒產生也多,所以影響的範圍也特別的大。
     
    徐明達教授說「所以蝙蝠可以帶著病毒到處飛,到處去接觸(感染別人)」,但人類直接接觸到蝙蝠的機會很少,即使接觸也不容易直接引起突變,雖然(新冠病毒)跟蝙蝠定序有 96% 相似度,其中最重要的細胞受體的蛋白質不一樣,所以一定是有經過別的動物,經過變化,才變成新冠病毒。」
     
    「這就是中間宿主。」林口長庚副院長、也是感染科醫師的邱政洵說,「冠狀病毒的自然宿主是果子狸跟蝙蝠,病毒接觸到中間宿主可能會停留一下,再傳染給人,但因為人不是自然宿主,病毒不會跟我們共存傳很久,所以之前像是 SARS、MERS 才會被控制住。」
     
    所以邱政洵醫師很樂觀的認為,只要人類控制好跟動物的界線、不要輕易接觸野生動物、不要侵犯動物的領域,保持防疫觀念,新冠病毒還是有機會可以完全消失[4]。
     
    2003年,SARS來襲。相隔17年後,新冠病毒帶著超強的感染力襲捲而來,現代文明社會遭受前所未見的打擊,幾乎全面停擺。面對不斷演變的新冠病毒,科學家在基因組定序、結構生物學、公衛及流行病防治等領域有了長足的進步,在短短數個月內,我們已能一窺新冠病毒的面貌及作用機制,同時擬定治療策略。
     
    即使潘朵拉的盒子已經打開,這些無價的科學研究讓我們面對疫情時不會一籌莫展。在黎明來臨之際,世界必須團結一致,共同對付這個危險的敵人,相信不久之後,我們能戰勝這場嚴峻的瘟疫[1]。
     
    【Reference】
    1.來源
    ➤➤資料
    [1] 《科學人》粉絲團「打開新冠病毒的潘朵拉盒子」:https://bit.ly/3BM5a9e、(Yahoo新聞)https://bit.ly/2YkoITx
    [2](臺灣醫學會)「什麼是病毒」:http://www.fma.org.tw/2009/bio-1.html
    [3](國研院國網中心 )「病毒與人-從SARS的流行談起 (▸演講人/陳建仁) (科學發展 2003年6月,366期)」:http://science.nchc.org.tw/science/science2005/Papers/c4academician/9206-08.pdf
    [4](Heho健康)「病毒是比人類更高級的存在!台灣 4 大病毒學家:新病毒會不斷產生,只求和平共存」:https://heho.com.tw/archives/93282

    ➤➤照片
    [1]科學家揭露新冠病毒基因組和棘蛋白胺基酸序列,探索其感染機制。

    2. 【國衛院論壇出版品 免費閱覽】
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    https://forum.nhri.edu.tw/publications/
      
    3. 【國衛院論壇學術活動】
    https://forum.nhri.org.tw/events/
      
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  • 基因 在 Facebook 的最佳貼文

    2021-10-01 04:27:43
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    覺得應該要紀錄一下今天的事件與我的心情。
    或許也希望住在異國的同溫層彼此分享與安慰🤔

    今天,小艾在睡前,跟我說⋯

    我的頭髮跟媽媽一樣,妹妹的頭髮跟爸爸一樣~可是妹妹是個女生。
    我跟小艾說,對啊~妹妹的頭髮也會長長,之後就跟你和媽媽一樣是長頭髮了,只是妹妹的頭髮比較咖啡色一點點。
    不過,男生也可以留長頭髮呀!就像是你的乾爹一樣~他也是長頭髮呀!

    媽媽,我想要我的頭髮是金色的⋯
    跟Rapunzel一樣,黃黃的~

    (我聽到這番話其實有點驚訝⋯)

    喔?為什麼呢?
    你覺得金金的頭髮很漂亮是嗎?
    對啊!我想要我的頭髮也是金色的⋯⋯

    那妳不喜歡媽媽和妳的頭髮顏色哦?
    不喜歡~
    為什麼不喜歡呢?
    你不喜歡媽媽的頭髮顏色嗎?
    不喜歡~
    那怎麼辦呢?
    我和媽媽的頭髮換一個顏色就好了呀!

    (此時我有一點難過了⋯⋯⋯)

    那⋯⋯⋯還是你想要換一個媽媽嗎?
    不要~
    我們把頭髮變顏色就好了啦!
    為什麼你會想要金金的頭髮?是因為你的同學都是金金的頭髮對嗎?
    對⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

    #小艾的金髮同學佔八成以上
    (此時我已經內心大暴走)

    妳知道頭髮的顏色還有身體的每一個部分⋯⋯都是從爸爸媽媽的基因來的嗎?
    你已經是最完美最棒的了!!
    每一個人生出來都是很特別的人!
    要最愛自己知道嗎?

    知道⋯⋯

    (說了一堆她能做到的事情然後死命稱讚她)

    妳覺得poo poo能吃嗎?
    不能~
    那如果你的同學還有朋友全部的人都吃poo poo…你要吃嗎?
    不要~
    那你知道你自己可以判斷很多事情~
    為什麼想要跟大家一樣呢???
    你如果想跟大家一樣⋯⋯⋯
    跟媽媽回台灣,大家頭髮也都是黑色的啊!
    本來這個世界上就是有很多不同顏色⋯
    只是你剛好同學都是金色的頭髮呀⋯⋯
    要最愛自己,知道嗎?

    其實跟小艾說了這些話之後,
    我一直在思考…..
    是因為這個年紀的小孩開始想要跟同儕一樣嗎?
    還是她只是純粹喜歡金色的頭髮⋯
    或是在學校有其他小朋友跟他說了什麼?
    還是只是我自己內心的恐懼?
    害怕擔心自己的孩子自信心不足?
    是不是反應過度?
    我的反應過度會不會造成他心裡面的創傷?

    我住的這個區域,學校確實大部分都是金頭髮的小孩⋯⋯
    我想這個是我目前遇到的第一個大挑戰,
    要怎麼樣讓小艾了解,
    要怎麼樣讓他自我認知,
    要怎麼樣闡述由內散發出來的自信心⋯⋯⋯
    我想這個是一直需要精進課題。

  • 基因 在 命運好好玩 官方頻道 Youtube 的精選貼文

    2021-09-30 21:00:11

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    【分段重點】
    00:00 開場介紹
    10:00 女兒多才多藝 讓溫翠蘋好驕傲
    14:30 手面相大解析 有優良基因的女人
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    29:13 女兒太單純媽媽擔心將來會吃虧!
    32:50 女兒不夠賢慧媽媽看不下去?!
    35:10 女兒個性超低調 卻意外被人關注!
    38:36 星座大解析 不會讓家人操心的星座
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    50:55 紫微大解析 看男人眼光精準的女人
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  • 基因 在 Albee三寶媽 教養生活 Youtube 的精選貼文

    2021-09-30 20:00:19

    晚上時間Albee來上菜囉🥰
    來分享一道台灣人都愛的滷豬腳~
    滷豬腳醬油很重要,選對了味道對了,也吃得安心
    還記得第一次吃家常滷肉是什麼時候嗎?
    我最愛下課回家時,打開門聞的陣陣的滷肉香
    還沒開動,我的肚子就會咕嚕咕嚕叫😁
    今天三寶爸點菜,突然想吃滷豬腳
    還指定要QQ的豬腳,古早味的那種

    哈哈~所以就有這一集分享給大家啦!
    這集應該是最詳細的家常滷豬腳滷肉分享
    👉豬腳如何去血水去腥味
    👉李錦記頭道醬油推薦:如何挑選醬油、不同醬油要如何搭配料裡
    👉用電鍋加瓦斯爐搭配滷肉最省時方便

    餐桌菜色有
    👉家常媽媽古早味滷豬腳滷肉
    👉蠔鮮蒸魚
    👉洋蔥炒蛋
    👉炒青菜

    很豐富的一集,希望你們也會喜歡
    一起來看影片吧💓💓

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    #Albee三寶媽咪來上菜
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  • 基因 在 常常好食Good Food Youtube 的最佳解答

    2021-09-30 15:30:27

    三餐外食、久坐又缺乏規律運動,你也正為腹部日漸囤積的脂肪所苦惱嗎?
    腹部肥胖不僅影響外觀,堆積在腹部的內臟脂肪更可能引起發炎,並誘發動脈硬化、高血壓、糖尿病等疾病。

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    劉博仁 醫師/博士 台灣基因營養功能醫學會理事長
    陳建霖 醫師 愛群婦幼中西醫聯合診所 院長
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