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血清抗體篩檢的判讀
#sars #lab #ab
彰化縣衛生局的新冠肺炎血清抗體篩檢有下列五大目的:了解盛行率、阻斷可能感染源、了解感染後的免疫反應、了解族群免疫可能性、有助疫苗研發。
診斷新冠肺炎的金標準是 PCR。但是陳前副總統健仁說用血清抗體篩檢在盛行率很低(百萬分之 20)的台灣可能會高估陽性率。
彰化縣衛生局的方法是針對高危險群檢驗 Roche Elecsys(N 蛋白抗體)陽性者再做 S 蛋白抗體,當二者都是陽性時再送到 P3 實驗室做中和性抗體(當成「金標準」)。由兩個不同實驗室為 5 位確診個案及 5 位未確診個案盲測中和抗體的一致性是 100%(95% 信賴區間 57-100%)。
結果發現中和性抗體的陽性率是 0.083%(4/4841,95% 信賴區間 0.002-0.16%):確診者(18 人)的 N 及 S 蛋白/中和性抗體持續 3-5 個月,而陽性率是18/18(100%,82.4-100%)。居家檢疫者(1548 人)陽性率 2/1(0.06%,0-0.2%),確診者的接觸者(362 人)陽性率 3/3(0.83%,0-1.8%),醫療照護者/防疫人員(2931 人)陽性率 0/0(0%,0-0.1%)。
Roche Elecsys 檢驗的特異性是 99.8%(99.7-99.9%),亦即假陽性率 0.2%(0.1-0.3%)。理論上在 4841 人中會有 10(5-15)名假陽性者。實際上是在 15 名 N 抗體陽性者中,扣掉 4 名中和抗體陽性者,仍然有 11 名。N 抗體的假陽性率是 11/4841(0.23%,0.09-0.36%),因此 N 抗體的陽性率是在假陽性的範圍內。
如果 N 抗體陽性,那麼中和抗體的陽性率是 4/11(36%,8-65%),如果 N 及 S 抗體都是陽性,那麼中和抗體的陽性率是 4/5(80%,45-100%)。
雖然彰化是用中和性抗體(PRNT,plaque reduction neutralization test) 當成「金標準」,但是當用 PCR 當成真正的金標準時,PRNT 的敏感性是 42/45(93.3%,86-100%),特異性是 34/35(97.1%,92-100%);假陰性率 6.7%(0-14%),假陽性率 2.9%(0-8%)。亦即 PRNT 的陽性率 0.083%(0.002-0.16%)是在假陽性的範圍內。
因此彰化縣衛生局的血清抗體篩檢結果無法排除是假陽性。
二項式分佈變數 95% 信賴區間的計算方法:
binom.CI(): function to calculate confidence intervals for binomial data
https://rpubs.com/brouwern/binomialCI2
https://www.facebook.com/937931539621002/posts/3213303572083776/?extid=GJV49jW0oZw0WZA6&d=n
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#東京僅有千分之一的人有新冠抗體
日本厚生勞動省16日公布東京、大阪、宮城三個都府縣的新冠病毒抗體檢查結果。東京人體內有抗體者占0.1%,大阪占0.17%,感染人數少的宮城占0.03%。厚勞省表示,大多數日本民眾的體內沒有新冠病毒的抗體。
日本厚生勞動省選擇了每十萬人感染數最多的東京和大阪,還有感染數極少的宮城縣來做檢測。從6月1日至7日,隨機抽樣20歲以上一般住民7950人進行抗體檢查,為講求檢查的正確,還用瑞士羅氏(Roche,ロシュ)還有美國亞培(Abbott,アボット)的2種試劑,兩種試劑測試都呈陽性的話,才判定體內有新冠病毒抗體。
結果如下:
東京1971人:陽性2人(0.1%)
大阪2970人:陽性5人(0.17%)
宮城3009人:陽性1人(0.03%)
在5月底的時點,東京,大阪,宮城確診的新冠盛行率各自為0.038%,0.02%還有0.004%。雖然與此相比有抗體的人占比較高,但絕大多數的人都還是沒有新冠抗體的。
厚勞省最後也強調,對於新冠病毒的抗體會在體內持續多久,以及抗體是否可以預防二度感染,目前是不確定的。
04b解讀:
1.和之前Softbank的四萬人用快篩抗體檢查,還有其他一些規模較小的抗體檢查相比,這次檢查是隨機抽樣一般住民,不像之前的檢查多半是針對來到醫療機關或是自願者。以抽樣來說,理論上比較能反應整個母體的狀況。
2.這次厚勞省選用了三個測IgG抗體的試劑:
美國亞培(Abbott,アボット)(化學發光免疫測定法)
瑞士羅氏(Roche,ロシュ)(電氣化學發光免疫測定法)
美國美康 (Mokobio,モコバイオ) (螢光免疫測定法)
根據仿單,亞培的敏感性100%(95%信賴區間95.89~100),特異性99.63%(99.05~99.9)。羅氏的敏感性100%(88.1~100),特異性99.81%(99.65~99.91)。美康的敏感性89.52%(82.03~94.65),特異性99.36%(96.50~99.98)。
由於亞培和羅氏的敏感性和特異性都較好,因此選擇這兩個做為此次主要判讀結果的試劑。
3.在盛行率還算低的社區中,要小心偽陽性的問題。厚勞省選擇要兩個亞培和羅氏兩者皆陽才算是陽,用意就是要減少偽陽性的影響。白話文就是,明明沒有抗體的檢體,讓兩個試劑做出來都偽陽性的機率是極低的。
4.特異性較高的試劑,較沒有偽陽性的問題。結果中也有顯示美康的結果,在東京,大阪和宮城各自是21,37,36人陽性。應該是有比較高的偽陽性的問題。(用美康的結果,三地的抗體陽性率分別是1.07%,1.25%,1.2%。很顯然不合理,因為宮城的陽性率不應該和疫情嚴重的東京大阪兩地相當,顯然是偽陽性的誤差讓數值不精確而難以解讀了)
5.以東京的人口1400萬人來看,換算0.1%的抗體陽性率,推算東京可能有14000人曾染疫,是截至五月底確診的5236人的2.7倍。
以大阪府的人口882萬人來看,換算0.17%的抗體陽性率,推算大阪府可能有14994人曾染疫,是截至五月底確診的1783人的8.4倍。
以宮城縣的人口229萬人來看,換算0.03%的抗體陽性率,推算宮城縣可能有687人曾染疫,是截至五月底確診的88人的7.8倍。
比較一下,之前和大家算過,紐約估算已經感染過的人數是高達確診者的10倍。真實受到感染的人數,可能是檯面上確診數字的10倍左右是滿合理的。我個人覺得大阪宮城數字滿接近真實,東京則不知道為何這麼低。理論上應該要更高一些才是。
6.可能可以這樣解讀:#日本所謂沒診斷出的新冠黑數,#實際上沒有某些鄉民想像中的多。但,也和紐約時報一樣的結論。#我們離群體免疫還很遠。
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103指考數學重點!!!
(數乙)
1.多項式:有理根檢定/勘根/虛根成雙/二次函數的極值(應用題)
2.指對數:圖形/不等式/首尾數(注意複率問題)
3.排列組合:同物排列/選排問題/分組分堆/二項式(係數問題)/重複組合
4.機率:古典機率(骰子,銅板問題)/條件機率&貝士定理(很重要,多注意檢驗問題)
5.數據分析:標準差(很重要,兩組混合問題,扣除問題)/相關係數(很重要)/迴歸直線/圖形的判讀(很重要,比較標準差或相關係數的大小)/統計資料的伸縮平移(線性變換;很重要)
6.直線與圓:斜率/線性規劃(很重要,應用題或活用題)/圓與直線的位置關係(略看)
7.平面向量:加減法作圖/共線理論/內積/夾角,距離與面積
8.矩陣:乘法與性質(很重要)/馬可夫鏈(取球,穩定狀態)/反矩陣(很重要)
9.機率(II):隨機變數/期望值(很重要)/信賴區間(很重要,觀念題)
10.極限與函數:分式型,根式型,指數型的極限/無窮等比求和(重要)
(數甲)
1.多項式:同數乙(但二次函數的極值略)
2.指對數:同數乙
3.機率(I):古典機率/條件機率(很重要,檢驗問題)/獨立事件(過關問題,很重要)
4.三角:正餘弦/二倍角/三角測量
5.直線與圓:線性規劃(很重要,關念活用題)/圓與直線的位置關係
6.平面向量:共線理論/內積(重要)/四心(內,外,重,垂,略看)
7.空間向量:坐標系的設定問題/外積與體積(三階行列式,重要)
8.空間中的直線與平面:求平面方程式/距離與夾角(很重要)/幾何意義(必考)
9.矩陣:列運算(略看)/乘法(很重要,旋轉矩陣,遞迴問題)/馬可夫鏈(很重要)/反矩陣(很重要)/線性變換(必考,可參考102,97,96,94,92歷屆試題)
10.機率(II):隨機變數/期望值(重要)/獨立事件與二項式重複試驗(重要)
11.三角函數:圖形/疊合(很重要,最大最小距離,面積)/棣美佛(很重要,極式的乘除與旋轉)/n次方根
12.微積分:極限的求法(很重要,分式,根式,左右極限,0/0)/無窮等比求和(幾何圖形)/切法線的求法(很重要)/圖形的描繪與極值(必考,增減凹凸,反曲點,臨界點,根的個數,極值的應用)/定積分(必考,微積分基本定理,面積體積)
考生們可依上述重點,找相關的題型練習,必可在最短時間內獲得最大效益,加油嘍!
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