trans-，穿過、轉移。
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transact 交易、談判 (v.)
transaction 辦理、交易 (n.)
➡️ 金錢和商品經過交易 「穿越 (trans)」到對方手中
E.g. A record is kept of all the firm’s transactions.
公司的一切交易都有記載。
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transfer 搬運、轉換、調動、轉變 (v.)
transferable 可轉移的、可轉讓的 (a.)
E.g. We aim to provide our students with transferable skills.
我們的目的是讓學生掌握可用於不同工作的技術。
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transparent 透明的、顯然的、坦率的 (a.)
➡️ 光可以穿過 (trans)，所以是透明的
E.g. Alan is a man of transparent sincerity.
Alan是一個坦率誠懇的人。
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transmit 傳送、播送 (v.)
transmission 傳送、傳染、傳播 (n.)
E.g. Contaminated foods transmit infectious diseases.
被污染的食物傳播傳染病。
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transcribe 抄寫、謄寫 (v.)
transcription 抄本、抄寫 (n.)
➡️ 轉寫到某處
E.g. Clerk transcribes everything that is said in court.
書記員把法庭上所有的話都記錄在案。
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transplant 移植 (v.)
➡️ 器官從捐贈者體內「穿越 (trans)」到接受者體內
E.g.I think the heart transplant is a wonderful thing.
我認為心臟移植是一件神奇的事情。
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transgress 違法、違背、侵犯 (v.)
transgression 違法、違背、侵犯 (n.)
➡️ 超越 (trans) 章法的界限
E.g. The students were restricted not to transgress the bounds.

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細個果陣，A level bio 鄒sir 教 DNA RNA 果陣大半班瞓咗，我就仲剩返少少，先睇得明。

實實在在想想自己讀書時學過什麼，應是面對往後日子重要的事。

有人因為我早前就有關全民測試帖文，向民政署作出投訴，說我發佈「假新聞」。

首先，我不是傳媒工作者，亦沒有經營媒體；說我是發佈新聞，實在貽笑大方。如果投訴人不懂怎樣分辯News, Facts及Opinion，請收聽上星期日《903國民教育》的重溫。

我在電郵中，花了一些時間向民政專員講解《個人資料私隱條例》在保障生物資料如何薄弱。翌日，我看見政府公佈了計劃詳情，當中提及測試相關的私隱問題。而我便將以下的生物學概念，用英文在電郵中向民政專員詳細闡述一次。

#武漢肺炎 的測試叫「核酸檢測」，是因為你身體的DNA、RNA及病毒的RNA都是nucleic acids，即是中文「核酸」。

特區港府在其「全民測試」網站中提到關於DNA樣本的問題，「抽取樣本及檢測病毒核糖核酸（RNA）的過程會涉及測試者的細胞及其中的核糖核酸（RNA）⋯⋯因此檢測過程不會收集到任何關於測試者的脫氧核糖核酸（DNA）資料。」

以我僅餘有限的預科生物學知識，都察覺到看見當中的問題。假如你不懂又或者忘記了生物堂教授過的細胞知識，Google 一下吧。

雙鏈的DNA 是會經過 RNA Polymerase 產生單鏈pre-mRNA（信使核糖核酸）。而經過完整的Transcription （轉錄）過程後就會產生 mature mRNA。而mRNA 會被 rRNA+protein 的 Ribosome 做Translation，而tRNA就會將 mRNA 鏈中的RNA排序，帶着相對的Amino Acid 往Ribosome去，從而製造一條peptide chain 出來。而條chain 再加長下去，就是protein了。

如果都是不明白，可以參考這條2分鐘短片 https://www.youtube.com/watch?v=1THyMOk3WU0

於1970年，科學家 David Baltimore 及 Howard Temin 發現RNA病毒的酶（酵素）能夠在受感染的細胞「反轉錄」成互補DNA (cDNA) ，推翻當時生物學中心法則（Central Dogma)。該發現令他們獲得1975年諾貝爾醫學獎，並改變了生物醫學的研究方向。現在的HIV抑制藥物，就是基於該發現而研發出來。

亦即是說， RNA 是可以被反轉錄成cDNA，即是一段反映特定時間「已呈現」的DNA。Reverse Transcription 更亦是時時刻刻在身體中出現，是細胞複制DNA維持健康的過程。更甚的是，Reverse Transcription ( 反轉錄）已經是很商業化的實驗，Google 一下便看到會提供相關服務的公司多不勝數。

就算「全民測試」的試劑只牽涉到測試者RNA，現時亦可以透過Reverse Transcription收集到DNA資料，更不要說FAQ中說測試會涉及細胞、細胞、細胞（因為很重要所以要講三次）了。

武漢肺炎的冠狀病毒，是RNA病毒。如果用測試劑可以只留下樣本的病毒RNA，那當然無須過份擔心。但不幸的是，暫時應該未有大廠能夠做到只提取RNA病毒的試劑 。 所以一牽涉試劑，都會是抽取RNA，不管是人、是動物抑或病毒，都是一樣。

至於如果不用抽取RNA，但仍然沿用RT-PCR 的方法去驗一個人是否確診是否可行？答案是可以的。有韓國醫學科技公司研發了不用抽取RNA都可以化驗到武肺病毒在「反轉錄」的技術（http://www.seegene.com/…/complete_solution_for_the_covid_19…）。 醫學文獻更顯示測試的效率亦有80% （https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7204723/）。瑞典亦有公司提供相關服務（ https://www.reiniuslab.com/Home ）。

既然有更加尊重私隱減少疑慮的技術，為何林鄭港府都不用，偏偏受到港人質疑要用中國技術？這個，就留待你解答了。

#生醫碎碎念 #訊息傳遞路徑 #MAPK_pathway #
【MAPK 信息通路的 3D 動畫】
　
我們身體裡的細胞除了維持內在環境的平衡，也和外界刺激有頻繁的互動；這些互動常常是由荷爾蒙、細胞外基質、或是神經傳導物質與細胞上的受體結合，產生一整串複雜的生化反應，最後改變細胞的行為——「細胞信息傳遞」是生理和藥理的基礎，大家或多或少都在課本上讀過，但是將一整條信息通路畫成精彩又真實的 3D 動畫，你看過嗎？
　
MAPK (mitogen-activated protein kinase)，中文譯名為「絲裂原活化蛋白激酶」，掌管細胞裡多種基本生物程序，對於細胞增生、分化、移動、存活或凋亡特別重要，因此從事癌症研究的朋友都會對這一類的信息通路特別熟！
　
這個動畫中描繪的表皮生長因子（EGF, epidermal growth factor）通路，是最典型的受體酪胺酸激酶（receptor tyrosine kinase）和 MAPK 通路之一：
　
小型蛋白 EGF 是刺激細胞存活和生長的因子，它在細胞外液遊蕩，找到了並結合自己最喜歡的受體：表皮生長因子受體（EGFR）。這個受體有一隻滑稽的腳腳，原來是受體酪胺酸激酶這個家族的特徵，有激酶的功能；它被 EGF 刺激到之後，與另外一個受體酪胺酸激酶 HER2 形成二聚體，兩個受體比雙胞胎更有默契、感情更好，兩隻腳腳晃來晃去之間，運用自己的激酶功能幫對方貼上磷酸標籤，這時 MAPK 通路的分子派對才剛剛開始！
　
這些閃亮亮的磷酸吸引了一群蛋白質好友來排隊：首先報到的 GRB2 把來自細胞外的信息傳給細胞內的可溶性蛋白們，例如 SOS。SOS 很花心，輪流和很多個小 GTP 酶蛋白 Ras 跳舞，讓信號被放大、擴散，跳著舞的 Ras 精神振奮，將 GDP 換成高能量的 GTP，一路沿著細胞膜離原來的受體越跳越遠。
　
Raf 看到了跳舞的 Ras 也很想加入，但是它的身邊有兩個 14-3-3 像嚴格的父母一樣死死地盯著、壓著自己（14-3-3 是我見過名字最奇怪的蛋白質之一，居然是它在色譜層析的溶析部份和在凝膠電泳裡移動的位置，會不會取得太隨便了點？）。
　
好不容易甩掉 14-3-3 的 Raf，終於可以一展身手，改變自己的形狀與 Ras 結合，很多對 Ras-Raf 聚在舞池當中放閃，吸引其他蛋白質的注意；但是只甩掉 14-3-3 還有與 Ras 結合是不足以激活 Raf 的，因此 Raf 的好朋友 SRC 遞給它一個磷酸，這個磷酸化比能量飲料還有效，興奮的 Raf 將信息傳給了更多細胞內的蛋白質，例如 MEK 和 ERK（這些蛋白質之間的互動都有各種熱心的支架蛋白【scaffold proteins】幫忙拉進彼此距離、增加效率）。
　
不同於以上的其他蛋白，ERK 有一個重要的使命，被激活的 ERK 獨自踏上了細胞核之旅，路過細胞骨架、穿越形狀詭異的核孔門關，直到把信息傳給住在細胞核內的 MYC 才算完成了它的任務。MYC 是一個很厲害的轉錄因子（transcription factor），負責轉錄多達 15% 的基因！原來 ERK 傳遞給 MYC 的是一面免死金牌，使它免於被蛋白酶體（proteasomes）像碎紙機一樣快速分解消化掉。
　
MYC 與好基友 MAX 形成雙聚體，成剪刀形坐在特定的 DNA 序列上，它們的工作是召喚組蛋白乙醯化酶（histone acetyltransferase），在組蛋白上加上乙醯；因為 DNA 本身就帶有負電荷，也帶負電的乙醯使 DNA 與組蛋白分離，讓細胞核內的轉錄分子機器可以接近 DNA、開始表現這些基因。MYC-MAX 還有另外一招可以影響 DNA 的表現：和構造相似的 MAD-MAX 雙聚體結合，形成雙雙聚體，交叉聯結兩段 DNA。
　
透過這些非常複雜的細胞信息傳遞通路，小小的細胞外蛋白質 EGF 就足以啟動一整個系統的分子機器，把細胞搞得很忙，改變了整個細胞的基因表現模式，進而調節細胞的生長和行為。這條信息通路出問題可能會導致細胞異常增生，也就是癌症，難怪有史以來 MAPK 通路一直是癌症治療和藥物研發的研究重點！
　
現在可以觀賞這麼精美的動畫學生物學真是幸福，比死背課本上描述細胞信息傳遞的枯燥文字例如 Gs -> adenylyl cyclase -> cAMP -> PKA -> CREB 生動有趣多了，也更容易記住，真希望以前修生化和藥理學時，所有主要的信息通道都有這樣的動畫！
　
在修神經生理和藥理學時，我初嚐細胞信息傳遞的複雜，複雜到一位神經生理學教授說簡直是「惡夢的網路（web of nightmare）」，我問藥理學教授 Dr. Dana Selley：「細胞隨時都接收到一大堆不同的信號分子，細胞內的信息傳遞系統又那麼複雜，細胞怎麼不會搞糊塗了呢？」
　
Dr. Dana Selley 笑著回答：「會呀，那就叫病理現象（pathology）！」
【MAPK 信息通路的 3D 動畫】
我們身體裡的細胞除了維持內在環境的平衡，也和外界刺激有頻繁的互動；這些互動常常是由荷爾蒙、細胞外基質、或是神經傳導物質與細胞上的受體結合，產生一整串複雜的生化反應，最後改變細胞的行為——「細胞信息傳遞」是生理和藥理的基礎，大家或多或少都在課本上讀過，但是將一整條信息通路畫成精彩又真實的 3D 動畫，你看過嗎？
MAPK (mitogen-activated protein kinase)，中文譯名為「絲裂原活化蛋白激酶」，掌管細胞裡多種基本生物程序，對於細胞增生、分化、移動、存活或凋亡特別重要，因此從事癌症研究的朋友都會對這一類的信息通路特別熟！
這個動畫中描繪的表皮生長因子（EGF, epidermal growth factor）通路，是最典型的受體酪胺酸激酶（receptor tyrosine kinase）和 MAPK 通路之一：
小型蛋白 EGF 是刺激細胞存活和生長的因子，它在細胞外液遊蕩，找到了並結合自己最喜歡的受體：表皮生長因子受體（EGFR）。這個受體有一隻滑稽的腳腳，原來是受體酪胺酸激酶這個家族的特徵，有激酶的功能；它被 EGF 刺激到之後，與另外一個受體酪胺酸激酶 HER2 形成二聚體，兩個受體比雙胞胎更有默契、感情更好，兩隻腳腳晃來晃去之間，運用自己的激酶功能幫對方貼上磷酸標籤，這時 MAPK 通路的分子派對才剛剛開始！
這些閃亮亮的磷酸吸引了一群蛋白質好友來排隊：首先報到的 GRB2 把來自細胞外的信息傳給細胞內的可溶性蛋白們，例如 SOS。SOS 很花心，輪流和很多個小 GTP 酶蛋白 Ras 跳舞，讓信號被放大、擴散，跳著舞的 Ras 精神振奮，將 GDP 換成高能量的 GTP，一路沿著細胞膜離原來的受體越跳越遠。
Raf 看到了跳舞的 Ras 也很想加入，但是它的身邊有兩個 14-3-3 像嚴格的父母一樣死死地盯著、壓著自己（14-3-3 是我見過名字最奇怪的蛋白質之一，居然是它在色譜層析的溶析部份和在凝膠電泳裡移動的位置，會不會取得太隨便了點？）。
好不容易甩掉 14-3-3 的 Raf，終於可以一展身手，改變自己的形狀與 Ras 結合，很多對 Ras-Raf 聚在舞池當中放閃，吸引其他蛋白質的注意；但是只甩掉 14-3-3 還有與 Ras 結合是不足以激活 Raf 的，因此 Raf 的好朋友 SRC 遞給它一個磷酸，這個磷酸化比能量飲料還有效，興奮的 Raf 將信息傳給了更多細胞內的蛋白質，例如 MEK 和 ERK（這些蛋白質之間的互動都有各種熱心的支架蛋白【scaffold proteins】幫忙拉進彼此距離、增加效率）。
不同於以上的其他蛋白，ERK 有一個重要的使命，被激活的 ERK 獨自踏上了細胞核之旅，路過細胞骨架、穿越形狀詭異的核孔門關，直到把信息傳給住在細胞核內的 MYC 才算完成了它的任務。MYC 是一個很厲害的轉錄因子（transcription factor），負責轉錄多達 15% 的基因！原來 ERK 傳遞給 MYC 的是一面免死金牌，使它免於被蛋白酶體（proteasomes）像碎紙機一樣快速分解消化掉。　MYC 與好基友 MAX 形成雙聚體，成剪刀形坐在特定的 DNA 序列上，它們的工作是召喚組蛋白乙醯化酶（histone acetyltransferase），在組蛋白上加上乙醯；因為 DNA 本身就帶有負電荷，也帶負電的乙醯使 DNA 與組蛋白分離，讓細胞核內的轉錄分子機器可以接近 DNA、開始表現這些基因。MYC-MAX 還有另外一招可以影響 DNA 的表現：和構造相似的 MAD-MAX 雙聚體結合，形成雙雙聚體，交叉聯結兩段 DNA。
透過這些非常複雜的細胞信息傳遞通路，小小的細胞外蛋白質 EGF 就足以啟動一整個系統的分子機器，把細胞搞得很忙，改變了整個細胞的基因表現模式，進而調節細胞的生長和行為。這條信息通路出問題可能會導致細胞異常增生，也就是癌症，難怪有史以來 MAPK 通路一直是癌症治療和藥物研發的研究重點！
現在可以觀賞這麼精美的動畫學生物學真是幸福，比死背課本上描述細胞信息傳遞的枯燥文字例如 Gs -> adenylyl cyclase -> cAMP -> PKA -> CREB 生動有趣多了，也更容易記住，真希望以前修生化和藥理學時，所有主要的信息通道都有這樣的動畫！
在修神經生理和藥理學時，我初嚐細胞信息傳遞的複雜，複雜到一位神經生理學教授說簡直是「惡夢的網路（web of nightmare）」，我問藥理學教授 Dr. Dana Selley：「細胞隨時都接收到一大堆不同的信號分子，細胞內的信息傳遞系統又那麼複雜，細胞怎麼不會搞糊塗了呢？」
Dr. Dana Selley 笑著回答：「會呀，那就叫病理現象（pathology）！」

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The Molecular Interactions of the MAPK Pathway