[爆卦]imagej灰階值是什麼?優點缺點精華區懶人包

為什麼這篇imagej灰階值鄉民發文收入到精華區:因為在imagej灰階值這個討論話題中,有許多相關的文章在討論,這篇最有參考價值!作者boblu (六百)看板Biotech標題Re: [求救] 關於定量灰階的圖時間Fri Mar ...


灰階影像的定量其實很 tricky

最大問題是訊號強度跟實際濃度通常不是線性相關

因此定量很難作

再加上樣本之間的 background 如果有差異 連定性的結果都很可疑

比方說 A 的背景值 10, 訊號值 30; B 的背景值 150 訊號值 170

要說 A B 相同我實在很難接受

作檢量線當然是最好的 可是組織染色的東西要拿 "已知量" 來作檢量線到底怎麼作啊?

只有在背景值差不多的狀況下 勉強可以對差異很大的結果作定性的描述吧

用imageJ作影像定量 通常會選擇:

將選取的範圍的訊號值加總 或是 選取範圍內平均每個畫素的訊號值

這兩個數字意義各不相同 要用哪個得看個別實驗的目的

在imageJ 下的analyze 選單下面選 set measurements

把area, mean gray valu, 還有 integrated density 勾起來

開啟你的灰階檔案 黑白反轉之
(8 bit 灰階檔案的 000 是黑, 255 是白。
黑白反轉就是拿 255 去減每個畫素原本的訊號值
得到的數字跟才代表訊號強度)

選取你要測量的區域 按 ctrl + M 就會跳出一個結果數值的視窗嚕

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※ 編輯: boblu 來自: 71.10.75.57 (03/26 08:12)
knownany:感激不盡~~!!!!! 03/29 10:04
boblu:啊 沒注意到你原本的是螢光影像 螢光影像不要黑白反轉喔 05/26 11:34

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