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作者: spermshout (醫院爆破隊隊長) 看板: medstudent
標題: 生物化學三小時速成 BBS版-1
時間: Sat Jul 29 00:55:40 2006

生化三小時速成 Editor:陽明大學94級 李政家
一、蛋白質的結構與功能(命中率：70%)
甲、20種胺基酸的分類(口訣)
i. with aliphatic side chain (Glavi吃飽了)
Gly, Leu, Ala, Val, Ile
ii. with side chain containing OH group(STY用水療)
Ser, Thr, Tyr
iii.with side chain containing sulfur atoms(MC流出來)
Met, Cys
iv. acidic group of their amides
Asp, Asn, Glu, Gln
v. basic groups(鹼查有LAH)
Lys, Arg, His
vi. aromatic groups(High-Frequency Wave Y)
His, Phe(F), Tyr(Y), Trp(W)會吸收240nm以上紫外光，特別是Try
vii.imino groups
Proline
乙、必需胺基酸：((FT VW MILK，開小福斯(fetal VW)買牛奶是一定要的))
Phe(F), Thr(T), Val(V), Trp(W), Met(M), Ile(I), Leu(L), Lys(K)
半合成胺基酸：(LAH後兩個)
Arg, His

丙、Glutathione = Glu + Cys +Gly考了n次，如果再錯，請自己切腹

丁、分離peptide的方法：
i. 6N HCL 月太腱全破壞
ii. ENZYME：Trypsin 切Arg, Lys
Chymotrypsin 切Tyr, Phe
Pepsin 切Tyr, Phe, Leu
Carboxylpeptidase 切多月太的N端，自C端開始切
Aminopeptidase 切多月太的C端，自N端開始切

戊、Bohr effect：H+↑, T↑, 2,3 DPG↑, CO2↑曲線右移
記法：只要上升的都向右移，只要特別記是H+不是PH值

己、Glycogenic aa 很多
Ketogenic aa 只有一個：Leu
Mixed aa 同FT VW MILK去除MV(不是很好背，可是考過)


二、酉每動力學(命中率：50%)


甲、Michaelis- Menten 方程式
i. Vmax/V = Km/[s] +1
ii. Km = K-1+K2/K1
iii. 一定要背的是V = 1/2Vmax 時，Km = [s]

乙、 Lineweaver-Burk 描圖座標系---Michaelis- Menten 方程式倒數作圖
i. 競爭性抑制 Vmax不變，Km變大(搶active site)
ii. 非競爭性抑制 Vmax變小，Km不變(阻斷enzyme活性)
iii.未競爭性抑制 Km/Vmax不變，但Km變小，Vmax變小(ES結合後，抑制劑再阻斷)
PS 若有生化學十日速成，圖在42頁

丙、活化能<0，反應向右



三、細胞代謝的原理(命中率：80%)
甲、NADH無法通過粒腺體的膜，靠 1)G3p shuttle →2ATP
2)Malate shuttle →3ATP
--------------------------------------------------------------------------------
Succinate
Choline
粒腺體內膜進行 －－＋－－－(-)malonate
∣
↓
FAD
∣
↓
Pyruvate→Lipoate→Fp→NAD→FMN→Q→Cyt b→Cyt C1→Cyt C →Cyt aa3→O2→H2O
↑ ↑ ↑ ↑
α-KG──┘ Rotenone Antimycin A Cytochrome oxidase
Piericidine A Dimercaprol H2S
Amobarbital CO
CN-
COMPLEX
藍：complex 1 紅：complex 2 綠：complex 3 紫：complex 4(含Cu)

每一mole之H+進入呼吸鏈可得3mole的ATP，分別是
NAD→FMN
Cyt b→Cyt C1
Cyt aa3→O2

框框內為阻斷劑，很難背，但會考，尤其是H2S，CO，CN-……
Uncoupling agent: Dinitrophenol, 氧化作用進行，但無法磷酸化，形成ATP
Oligomycin阻斷H+進入膜內，同時阻斷氧化，磷酸化，所以不是uncoupling agent
--------------------------------------------------------------------------------
四、碳水化合物(命中率：80%)


甲、各糖類支鏈：maltose α(1, 4)
lactose β(1, 4)
直鏈澱粉 α(1, 4)
支鏈澱粉 α(1, 4) α(1, 6)
Glycogen α(1, 4) α(1, 6) 分支更多
Cellulose β(1, 4)
Inulin β(1, 4)果糖聚合物
Chitin N-acetyl-D-glycosamine以β(1, 4)連結

乙、Glycolysis
G → G6P → F6P → F1, 6P → DHAP
↑ Aldose∣
∣ └───→ Glyceraldehyde-3-P '接下面
6-phospofructokinase(key enzyme)

Glyceraldehyde-3-P→1,3bisphosphoglycerate→3-phosphoglycerate→phosphoenop
yruvte→pyruvate

重點

消耗ATP*2: G → G6P，F6P → F1, 6P
產生ATP*4: 1,3bisphosphoglycerate → 3-phosphoglycerate
Phosphoenopyruvte → pyruvate
產生NADH: Glyceraldehyde-3-P → 1,3bisphosphoglycerate
淨產值: 2ATP+1NADH→若有氧，有8ATP

丙、Pyruvate──────────────→acetyl-CoA
i. 產一個NADH
ii. 需三個Enzyme：pyruvate decarboxylase, Dihydrolipoyltransacetylase
Dihydrolipoyl dehydrogenase
iii. 需五個Coenzyme: Thiamine, FAD, NAD, CoA, Lipoid acid

丁、TCA cycle
i. 產能之處：記得口訣MISK 後面再加Dehydrogenase即可
1.Isocitrate NADH
2.α-KG NADH
3.Succinate FAD 共12個ATP
4.Malate NADH
另有Succinyl-CoA GTP
ii.會產生CO2處: Isocitrate→α-KG及α-KG → Succinyl-CoA

戊、以上，從glucose到完全消耗成為CO2及H20, 一共可生成38個ATP，你算出來了嗎？

己、Glycogen之代謝
GTP PPi Glycogen synthase
↘↗ ↓
G→G6P→ G1P→UDP-Glc→GLYCOGEN
↑ ↑
└────────┘
Phosphorylase

重點1、出入都是G1P不是G6P
2、是GTP→PPi
3、Glycogen synthase是key enzyme
4、cAMP可抑制Glycogen synthase，促進Phosphorylase
5、insulin抑制cAMP，epinephrine促進cAMP
所以insulin 促進肝糖合成
epinephrine促進肝糖分解

庚、 Gluconeogenesis
i.和glycolysis相反，只有三處不可逆(背！)
G → G6P hexokinase
F6P → F1,6P phosphofructose
phospoenolpyruvate → pyruvate pyruvate kinase

辛、 PPP
i. 不產ATP，但產NADPH (使用G6P dehydrogenase)
ii. 選項中只要是問NADPH的來源，都寫這一個

壬、 Hexokinase VS Glucokinase
分布多 只有肝
較不specific specific
low Km high Km
兩者G6P都為allosteric inhibitor



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