北極殿主祀玄天上帝,昔日當地人稱「松仔腳上帝廟」,據廟方沿革之記載, 相傳於明末清初有位福建剃頭師父, 渡海來台求發展, 為求庇祐, 遂將在家供奉的玄天上帝神像帶在身邊守護, 來台後因居無定所, 便攜帶神尊走遍府城大街小巷, 鄰近鄉鎮沿街剃頭. 於康熙46年( 1707)來到歸仁松仔下剃頭, 告一段落, 準備繼續前往下一個庄頭時, 扁擔卻抬不動, 有如生根紮住, 正感疑惑之際, 有一耆老提議用銅錢當筊在神像前請示, 經玄天上帝指示欲在此落腳. 地方士紳有感於上帝公靈感, 初時, 因陋就簡結草為屋, 而成為北極殿之肇基. 爾後, 乾隆56年（1791）、嘉慶19年（1841）、同治3年（1864）與光緒32年（1906）皆曾發起重建.

昭和3年(1928)在董事蔡等, 蔡溫發舉第四次重建時, 同時舉行第一次建醮大典.

民國48年(1959)管理人林九鍊倡議重修, 同年二月興工,十月竣工,十二月再度舉行醮典.

民國64年, 因廟宇年代久遠而壁蝕斑駁, 遂由廟方與信徒提議修繕, 於同年舉行五朝祈安大醮. 民國85年(1996), 由林語再度倡議重建, 至民國90年(2001)竣工, 成今日之廟貌, 並舉行首次五朝王醮. 🍀👍