針對「基北區104年免試入學修正方案」引發之爭議，教育部長吳思華於今年11/5公開表示「尊重地方自治，但北市需負責自行面對明年爭議。」鄭麗君在11/5審查教育部預算時，吳部長承諾10日前回覆；基北區6日公布修正方案，10日送教育部備查，國教署拖到30日才回覆台北市難以備查，如今又說要繼續溝通到年底。鄭麗君認為不管教育部與基北區之間的爭議如何，都應以學生的權益為重，不能聲稱北市需自負其責便蒙混過關，教育部必須盡速給台北市焦急等待的學生家長們一個確定的答案。
受少子化影響，教育部核准104年技專校院140科系停招，且明年度大學校院將有84個院系所學位學程停招；鄭麗君質疑這些系所學位學程的老師與學生是否得知停招的消息，且是否影響原修習該科系的學生？(例如某學生在四年前考上「桃園南亞技術學院建築系」，修習至大三時，校名改為桃園創新技術學院，且系名改為室內設計系，學校與科系名稱更改，將嚴重影響到該學生將來可報考建築師執照的資格。)鄭麗君認為，教育部每年核准增加與停招很多系所，學生的受教權利必須受到百分之百的保障。
鄭麗君認為12年國教在國中階段缺乏對學生深入的適性輔導與生涯規畫輔導，使得技職教育與普通高中教育一樣成為「照著傳統分數排序填志願」，導致適性分流的理想落空，更造成國家技術人才的空洞化與單一化。現在院版草案要求「高級中等以下學校應開設或採融入式支職業試探、生涯輔導課程」，但要如何落實才是今後最大的問題。鄭麗君說，依據現行12年國教總綱所規畫之課程時數，要求國中或國小開設職業試探、生涯輔導課程有實際上的困難，若採融入式教學法，授課教師是否具有相對的教案設計能力或切實輔導學生進行性向探索也是一大隱憂。教育部應確保國中小在教學方面能落實法條要求，如有必要，教育部應立即重啟程序，調整課綱。